Repêchage de la Ligue majeure de baseball 2016

Le repêchage de la Ligue majeure de baseball 2016 se tient du 9 au 11 juin 2016. Il s'agit de la 52e présentation du repêchage amateur de la Ligue majeure de baseball, un événement annuel dont des équivalents sont présents dans tous les sports collectifs nord-américains, comparable à une bourse aux joueurs, où les équipes sélectionnent des sportifs issus de l'université ou de l'école secondaire.

Les sélections se font sur 40 rondes, chacun des 30 clubs choisissant à tour de rôle, et un total de 1 216 joueurs sont en 2016 repêchés. Les sélections donnent le droit au club d'engager des négociations en vue de la signature d'un contrat.

Le tout premier athlète sélectionné est Mickey Moniak, un joueur de champ extérieur de l'école secondaire La Costa Canyon High School, à Carlsbad en Californie qui est réclamé par les Phillies de Philadelphie.

En incluant les choix supplémentaires compensatoires, 41 joueurs sont choisis au premier tour de sélection.