Championnat d'Azerbaïdjan de football 1999-2000

La saison 1999-2000 du Championnat d'Azerbaïdjan de football était la 9e édition de la première division en Azerbaïdjan. Appelée Top League, elle regroupe 12 clubs azéris regroupés en une poule unique où les équipes s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur. À la fin de la saison, les deux derniers du classement sont relégués en deuxième division et remplacés par les deux meilleurs clubs de First League.

Le FK Shamkir remporte le premier titre de champion d'Azerbaïdjan de son histoire en terminant en tête du classement, avec 11 points d'avance sur le double tenant du titre, le FK Gandja et 12 sur le FK Neftchi Bakou.